RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 CCNYL1Q8N7R7 359 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ICA1LQ8NDH6 482 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PKMYT1Q99640 499 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB26Q9HCK0 441 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 DSEQ9UL01 958 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TADA2AO75478 443 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 HLA-DQB2P05538 268 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CCR1P32246 355 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJB13P59910 316 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 POU4F1Q01851 419 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CNGA3Q16281 694 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF423Q2M1K9 1284 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 KDM1BQ8NB78 822 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PMPCBO75439 489 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ALDH1A3P47895 512 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SLC12A2P55011 1212 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R39P59534 338 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 GRAMD1BQ3KR37 738 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 MMEL1Q495T6 779 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM198Q66K66 360 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ZFP1Q6P2D0 407 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SCAMP5Q8TAC9 235 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TRPV6Q9H1D0 765 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 EFCAB1Q9HAE3 211 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO5Q9UKT4 447 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 DTNAQ9Y4J8 743 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 YY1P25490 414 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 THOP1P52888 689 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF470Q6ECI4 717 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PACSIN3Q9UKS6 424 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 B3GAT3O94766 335 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 JUNP05412 331 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 BRCC3P46736 316 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ART3Q13508 389 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 FLOT2Q14254 428 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ARMC3Q5W041 872 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 RANBP10Q6VN20 620 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA0408Q6ZU52 694 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 GALNT15Q8N3T1 639 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 MRGPRX2Q96LB1 330 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 OMDQ99983 421 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CTSHP09668 335 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM126BQ8IUX1 230 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC49Q8IUZ0 686 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 HEXDCQ8WVB3 486 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CENPKQ9BS16 269 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 WDR41Q9HAD4 459 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 GPR182O15218 404 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SEPT6Q14141 434 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 GRM2Q14416 872 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 AFMIDQ63HM1 303 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA6LQ8N4H0 392 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 POMKQ9H5K3 350 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 MYO16Q9Y6X6 1858 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 KPNA6O60684 536 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CHRNA1P02708 482 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CPB1P15086 417 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 NEPROQ6NW34 567 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ZFAND2BQ8WV99 257 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 M0QZQ0 153 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CFLARO15519 480 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ME2P23368 584 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 ARTNQ5T4W7 220 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 OR10T2Q8NGX3 314 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CEP70Q8NHQ1 597 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CASP10Q92851 521 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC126Q96EE4 140 aa26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms