RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TTC39CQ8N584 583 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CNTD1Q8N815 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PPTC7Q8NI37 304 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RDH11Q8TC12 318 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EME1Q96AY2 570 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CALN1Q9BXU9 219 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SDCBP2Q9H190 292 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 COPG2Q9UBF2 871 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CDH7Q9ULB5 785 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ENDOD1O94919 500 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HTR3BO95264 441 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARIH2O95376 493 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA4LO95757 839 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MPOP05164 745 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31D3P0C874 917 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HOXD10P28358 340 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MLH1P40692 756 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NR2C2P49116 596 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GALK1P51570 392 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP1Q07960 439 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB17Q13105 803 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C2CD6Q53TS8 623 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PIGGQ5H8A4 983 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MROH9Q5TGP6 573 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 STEAP4Q687X5 459 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EPGNQ6UW88 154 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC80Q76M96 950 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF597Q96LX8 424 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KATNBL1Q9H079 304 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CDH19Q9H159 772 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 USP18Q9UMW8 372 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 Q9Y3F1 56 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SIP14410 1827 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 APOL1O14791 398 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KCNN4O15554 427 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DCXO43602 365 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRPSAP2O60256 369 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HBP1O60381 514 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GCATO75600 419 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 STBD1O95210 358 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 VNN1O95497 513 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 APRTP07741 180 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NAMPTP43490 491 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PSMD8P48556 350 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT2P50583 147 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 OGDHQ02218 1023 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SP3Q02447 781 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TNFAIP2Q03169 654 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GAD2Q05329 585 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ART3Q13508 389 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZBED5Q49AG3 693 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PERM1Q5SV97 790 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 VHLLQ6RSH7 139 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZPBP2Q6X784 338 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDPRQ8NCN5 879 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.28□□□□□ -1.24
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