RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRAF1Q13077 416 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KLF10Q13118 480 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SMU1Q2TAY7 513 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYLK3Q32MK0 819 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FILIP1LQ4L180 1135 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CRB2Q5IJ48 1285 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BSPRYQ5W0U4 402 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LIPIQ6XZB0 460 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SYT13Q7L8C5 426 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC25Q86WR0 208 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 YAF2Q8IY57 180 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NUP43Q8NFH3 380 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DBF4BQ8NFT6 615 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GLMPQ8WWB7 406 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DNAAF4Q8WXU2 420 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SHC3Q92529 594 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RAB24Q969Q5 203 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BTBD6Q96KE9 485 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC46A2Q9BY10 475 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCSER1Q9C0I3 900 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DONSONQ9NYP3 566 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 XPR1Q9UBH6 696 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYH7P12883 1935 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NEURL1BA8MQ27 555 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 M0QX08 132 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DYNC1I1O14576 645 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SMIM24O75264 130 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLITRK3O94933 977 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GALTP07902 379 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLURP2P0DP57 97 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PTGS1P23219 599 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GLDCP23378 1020 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CASP9P55211 416 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RUNX1T1Q06455 604 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IFFO1Q0D2I5 559 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LMAN2Q12907 356 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC3Q13217 504 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMED1Q13445 227 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VEPH1Q14D04 833 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RTP5Q14D33 572 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUOXA2Q1HG44 320 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LETM2Q2VYF4 491 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM48Q8IWZ4 208 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RHOT1Q8IXI2 618 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HACE1Q8IYU2 909 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FSIP1Q8NA03 581 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ERLEC1Q96DZ1 483 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PIP5K1AQ99755 562 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CEP41Q9BYV8 373 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LRRCC1Q9C099 1032 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MIS18AQ9NYP9 233 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UBAP1Q9NZ09 502 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GPRC5DQ9NZD1 345 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SEPT10Q9P0V9 454 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SEMA5BQ9P283 1151 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf52A6NGY3 159 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZAR1LA6NP61 321 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NRP2O60462 931 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNF8O76064 485 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNA3P22001 575 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CPT2P23786 658 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1E1P36543 226 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HTR6P50406 440 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLCNKAP51800 687 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CDK5R2Q13319 367 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IL11RAQ14626 422 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PKN1Q16512 942 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RALGPS1Q5JS13 557 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms