RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM51Q9NW97 253 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROCRQ9UNN8 238 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC01553A4QN01 128 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 EBAG9O00559 213 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACOT8O14734 319 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNJ13O60928 360 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINI2O75830 405 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCGR1AP12314 374 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYF6P23409 242 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGB8P26012 769 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 BLKP51451 505 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF6Q58WW2 860 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCC1Q96CN9 775 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXNDC15Q96J42 360 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 YME1L1Q96TA2 773 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDT1Q9H211 546 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMM23O14925 209 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP2C2O75185 946 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFPIP10646 304 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSD3B1P14060 373 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTKP33981 857 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCT5P48643 541 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MXI1P50539 228 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ART1P52961 327 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST3GAL1Q11201 340 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUNX2Q13950 521 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 LPIN1Q14693 890 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFATC4Q14934 902 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF12Q16514 161 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RETSATQ6NUM9 610 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 BBS12Q6ZW61 710 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC105Q8IYK2 499 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMED6Q8WW62 240 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 HERVK_113Q902F9 699 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 WASF1Q92558 559 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTULINQ96BN8 352 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 EYA3Q99504 573 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYTNA2CJ06 578 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBY3A6NI87 242 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGM1P36871 562 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIFRP42702 1097 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPD2P43304 727 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDLIM4P50479 330 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCR5P51681 352 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLCN5P51795 746 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP10-9P60411 292 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRNDQ07001 517 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF5AQ12840 1032 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAF3Q13114 568 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113 ms