RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSPY26PQ9H489 355 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 GCM1Q9NP62 436 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLK2Q9NYY3 685 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO10Q9UK96 956 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYO6Q9UM54 1294 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 F5P12259 2224 aa7.71□□□□□ -1.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 K7ESF4 209 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACSL4O60488 711 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPHS1O60500 1241 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 DAB1O75553 588 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 APODP05090 189 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 MSL3P1P0C860 447 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 FERP16591 822 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 MMP8P22894 467 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFPP27918 469 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXC12P31275 282 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC6A4P31645 630 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRIA2P42262 883 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 MATKP42679 507 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 CXCL12P48061 93 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 DMWDQ09019 674 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTP4A2Q12974 167 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF385BQ569K4 471 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 FIGNQ5HY92 759 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRNP1Q6NT89 227 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 LZTR1Q8N653 840 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TERB1Q8NA31 727 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP33Q8TEY7 942 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NELL1Q92832 810 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 AZIN2Q96A70 460 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 AGPAT1Q99943 283 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYNCQ9H7C4 482 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFNKQ9P0W0 207 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEC1Q9P2X7 70 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRRT4C9JH25 899 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUAK1O60285 661 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSPAN3O60637 253 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATG13O75143 517 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 GJB6O95452 261 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 DBHP09172 617 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 FLT3P36888 993 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBL1P41271 181 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNFRSF4P43489 277 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC11A2P49281 568 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDK17Q00537 523 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 ASIC2Q16515 512 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2orf27AQ580R0 203 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 EMC10Q5UCC4 262 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 BNIPLQ7Z465 357 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDI1Q8WTU0 396 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NT5C3BQ969T7 300 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM122AQ96E09 287 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPY6RQ99463 290 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUP58Q9BVL2 599 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms