RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 HID1Q8IV36 788 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 FGF13Q92913 245 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 NMUR1Q9HB89 426 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 KLHL3Q9UH77 587 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CDH7Q9ULB5 785 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 TCHHQ07283 1943 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 COL4A1P02462 1669 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 RPN2P04844 631 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PRKCGP05129 697 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT4P19013 534 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 FGFR3P22607 806 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 IRS1P35568 1242 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK16Q00536 496 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ARSIQ5FYB1 569 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 OR10G6Q8NH81 332 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CD101Q93033 1021 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 VPS45Q9NRW7 570 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 M0QZQ0 153 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ZBTB14O43829 449 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 AGTP01019 485 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PGAM1P18669 254 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP2A7P20853 494 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ACVRL1P37023 503 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 AP1S1P61966 158 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 RUNX3Q13761 415 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ITGA9Q13797 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 AHI1Q8N157 1196 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ALLCQ8N6M5 410 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PRELID2Q8N945 189 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PAFAH2Q99487 392 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 FZD10Q9ULW2 581 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ASF1AQ9Y294 204 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 INSIG1O15503 277 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 NDST3O95803 873 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ASGR2P07307 311 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 HTR7P34969 479 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 GP5P40197 560 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 NDST2P52849 883 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 USP46P62068 366 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 STX3Q13277 289 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 DSC3Q14574 896 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MBTPS1Q14703 1052 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SRLQ86TD4 932 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 STK40Q8N2I9 435 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 OTUB2Q96DC9 234 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PHF21BQ96EK2 531 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PBX4Q9BYU1 374 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CITO14578 2027 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 BTN3A1O00481 513 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SH3BGRLO75368 114 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CNTN5O94779 1100 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 KAT7O95251 611 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MC4RP32245 332 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SERPINB8P50452 374 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK7P50613 346 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP2R2AP63151 447 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 IL1RL1Q01638 556 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 IL10RBQ08334 325 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 NOMO1Q15155 1222 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CRY1Q16526 586 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms