RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 GLP2RO95838 553 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 NAT2P11245 290 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 MAPKAPK2P49137 400 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 PCSK7Q16549 785 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 QPCTQ16769 361 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 MARC1Q5VT66 337 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 PALM2Q8IXS6 379 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.53■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1B0GVM2 712 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC78A2IDD5 438 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 MUSKO15146 869 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 MTSS1O43312 755 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 AGTP01019 485 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 HOXA9P31269 272 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 VIPR2P41587 438 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 25
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 CES3Q6UWW8 571 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM25Q86YD3 366 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 EXOC2Q96KP1 924 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 GLOD4Q9HC38 313 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TBK1Q9UHD2 729 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 TRHDEQ9UKU6 1024 aa16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CHTF18-202ENST00000317063 NDUFB5O43674 189 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MGAT1P26572 445 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MAGEA6P43360 314 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 DSC2Q02487 901 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CASC4Q6P4E1 433 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC63Q8NA47 563 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 IPMKQ8NFU5 416 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.52■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TPSB2P20231 275 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 KCNC3Q14003 757 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TPSAB1Q15661 275 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 PARP15Q460N3 678 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 C4orf22Q6V702 233 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 WNT6Q9Y6F9 365 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 E7ESA3 106 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 NUDT17P0C025 328 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 NIPAL4Q0D2K0 466 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 APCDD1Q8J025 514 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.51■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MMP13P45452 471 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 RENBPP51606 427 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 HYAL1Q12794 435 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CDH18Q13634 790 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MYLIPQ8WY64 445 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 VAT1Q99536 393 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 PRAMEF11O60813 436 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CSKP41240 450 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 KCTD11Q693B1 232 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 RELL1Q8IUW5 271 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MCUQ8NE86 351 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CCT6BQ92526 530 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MAML1Q92585 1016 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MAGEH1Q9H213 219 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TMCO1Q9UM00 188 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 GMEB1Q9Y692 573 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 GFRA2O00451 464 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM24O15164 1050 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 AP2A1O95782 977 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MT-CO1P00395 513 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MYZAPP0CAP1 466 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CD86P42081 329 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CHRNA4P43681 627 aa16.5■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 OXCT1P55809 520 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms