RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 USP30Q70CQ3 517 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 LONP2Q86WA8 852 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CACUL1Q86Y37 369 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF567Q8N184 647 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PGBD3Q8N328 593 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 PRELID2Q8N945 189 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ARRDC2Q8TBH0 407 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf54Q8WWF1 131 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RTP4Q96DX8 246 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SEMA3CQ99985 751 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CEP41Q9BYV8 373 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf88Q9H8K7 445 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ITM2CQ9NQX7 267 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 SEPT10Q9P0V9 454 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 TRHDEQ9UKU6 1024 aa13.4□□□□□ -0.26
CCDC42-201ENST00000293845 ABCA7Q8IZY2 2146 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN11A1L157 253 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 KCNN4O15554 427 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 GJB3O75712 270 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ITGAVP06756 1048 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ACADMP11310 421 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ITGB7P26010 798 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 STIP1P31948 543 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 GKP32189 559 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 DRD3P35462 400 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 FNTBP49356 437 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SLC14A2Q15849 920 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 KBTBD6Q86V97 674 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 AADATQ8N5Z0 425 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SPOCK2Q92563 424 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ECHDC3Q96DC8 303 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R16AQ96I34 528 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 AGAP3Q96P47 875 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 KCNH6Q9H252 994 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 NOD2Q9HC29 1040 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 DKK3Q9UBP4 350 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 FZD4Q9ULV1 537 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 THADAQ6YHU6 1953 aa13.39□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 C5orf60A6NFR6 353 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SOCS5O75159 536 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 STK10O94804 968 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 UGT2B4P06133 528 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA4P29622 427 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 P2RY2P41231 377 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TPMTP51580 245 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 METAP1P53582 386 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 GDF10P55107 478 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 DSC2Q02487 901 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 BCL2L1Q07817 233 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ITKQ08881 620 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 NIPAL4Q0D2K0 466 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 MAP7D1Q3KQU3 841 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 GDPD4Q6W3E5 623 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 PID1Q7Z2X4 250 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 ARRDC3Q96B67 414 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TADA1Q96BN2 335 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA13Q96N96 652 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 HDAC8Q9BY41 377 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 GLOD4Q9HC38 313 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 CD93Q9NPY3 652 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 FBXL12Q9NXK8 326 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TTLL3Q9Y4R7 772 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TRPM6Q9BX84 2022 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PP55 124 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PQ67 120 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 SLC7A4O43246 635 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 OPHN1O60890 802 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 LILRB5O75023 590 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 GCATO75600 419 aa13.37□□□□□ -0.27
CCDC42-201ENST00000293845 PIGNO95427 931 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms