RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 NLNQ9BYT8 704 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ASB8Q9H765 288 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CARNS1A5YM72 827 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SGTAO43765 313 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC20A2Q08357 652 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 INSCQ1MX18 579 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD5Q6N075 450 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ULK2Q8IYT8 1036 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 USP7Q93009 1102 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PWWP2AQ96N64 755 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PACS1Q6VY07 963 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 LHX5Q9H2C1 402 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 VAV3Q9UKW4 847 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD4Q9Y227 616 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TSC22D2O75157 780 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MARK4Q96L34 752 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 XPR1Q9UBH6 696 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ZMPSTE24O75844 475 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ACADMP11310 421 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CCNA2P20248 432 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GRIK5Q16478 980 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ARSHQ5FYA8 562 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf88Q6PI97 169 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 OR7A2PQ8NGA2 310 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 HGFP14210 728 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM139Q8IV31 216 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CDCA5Q96FF9 252 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 LGMNQ99538 433 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TRMOQ9BU70 441 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL11Q9BXB4 747 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CHKBQ9Y259 395 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 KLRC2P26717 231 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 IL12RB1P42701 662 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 AMER2Q8N7J2 671 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 A0A088AWK7 358 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DDR1Q08345 913 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DGCR6Q14129 220 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 FLT3P36888 993 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A5Q14940 896 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 HECTD3Q5T447 861 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CLYBLQ8N0X4 340 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB14Q8TBM8 379 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA3Q9NST1 481 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MYPNQ86TC9 1320 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 H0YC42 278 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TNNI3P19429 210 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SKP1P63208 163 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRNQ16849 979 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC3Q5W041 872 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA3CQ99985 751 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TINF2Q9BSI4 451 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SLITRK2Q9H156 845 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RPL3P39023 403 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RCN3Q96D15 328 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA2Q9UM82 520 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CORO2BQ9UQ03 480 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC28A1O00337 649 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MMP8P22894 467 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CXCR2P25025 360 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TCF12Q99081 682 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 OMDQ99983 421 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms