RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 KRT34O76011 436 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ARRB2P32121 409 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 NPY2RP49146 381 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ARSDP51689 593 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 NDST2P52849 883 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CYP4F8P98187 520 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 RING1Q06587 406 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ZNF33AQ06730 810 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ITIH4Q14624 930 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CHI3L2Q15782 390 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 OR6K2Q8NGY2 324 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SCYL1Q96KG9 808 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 KIFC1Q9BW19 673 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 TSSK1BQ9BXA7 367 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 GGA2Q9UJY4 613 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ITM2AO43736 263 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SNAP91O60641 907 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ANXA9O76027 345 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CRHR1P34998 444 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CCNFP41002 786 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 LBX1P52954 281 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 MPP3Q13368 585 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SLC12A1Q13621 1099 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 GALNT3Q14435 633 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CCDC6Q16204 474 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CCNJLQ8IV13 435 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 EFHBQ8N7U6 833 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 WFDC5Q8TCV5 224 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 KCNV2Q8TDN2 545 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 VPS39Q96JC1 886 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 RBBP8Q99708 897 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SLC25A51Q9H1U9 297 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 KCNK13Q9HB14 408 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SPG21Q9NZD8 308 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.73□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 TGM5O43548 720 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 FGF18O76093 207 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 HAUS5O94927 633 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 URODP06132 367 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 C2P06681 752 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 LINC00271P0C7V0 271 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 PRSS56P0CW18 603 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ELF1P32519 619 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 PLK1P53350 603 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SMARCB1Q12824 385 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 PCID2Q5JVF3 399 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 NXNQ6DKJ4 435 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 GAREM2Q75VX8 874 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 TTC7BQ86TV6 843 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 C10orf82Q8WW14 230 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ERP27Q96DN0 273 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CBX4O00257 560 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 NEMP1O14524 444 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 PDHA1P08559 390 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 TSPAN8P19075 237 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SERPINB9P50453 376 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 GEMP55040 296 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 RAB33AQ14088 237 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 C10orf107Q8IVU9 208 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 GPATCH11Q8N954 259 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 MTBPQ96DY7 904 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 CPNE1Q99829 537 aa5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
USP15-201ENST00000280377 IL21Q9HBE4 155 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms