RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 CYP4B1P13584 511 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ITGALP20701 1170 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 S100A3P33764 101 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SEPHS1P49903 392 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 TAS2R40P59535 323 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SNAPC2Q13487 334 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SQLEQ14534 574 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 KLHL31Q9H511 634 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ASB7Q9H672 318 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 PROX1Q92786 737 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 LGMNQ99538 433 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 RNF181Q9P0P0 153 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 RAB26Q9ULW5 256 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 MEGF6O75095 1541 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 A8MX80 341 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ADRB2P07550 413 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ITGAXP20702 1163 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 IL12AP29459 219 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SHMT1P34896 483 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 GTF2BQ00403 316 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 PRKG2Q13237 762 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF846Q147U1 533 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SYT12Q8IV01 421 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 CDK20Q8IZL9 346 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM159Q96B96 161 aa6.4□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0J9YYE9 177 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SLC7A2P52569 658 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 NOMO3P69849 1222 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 PHKG1Q16816 387 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 43.6
SBNO1-201ENST00000267176 CCNB1P14635 433 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 IDO1P14902 403 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 HPGDP15428 266 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 OXCT1P55809 520 aa6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-201ENST00000267176 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-201ENST00000267176 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 ACSS2Q9NR19 701 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-201ENST00000267176 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-201ENST00000267176 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-201ENST00000267176 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 CDH19Q9H159 772 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 BTRCQ9Y297 605 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-201ENST00000267176 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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