RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 POU2F2P09086 479 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC18A1P54219 525 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HPCAP84074 193 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ZXDBP98169 803 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TTC25Q96NG3 672 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0J9YVX5 310 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 KLKB1P03952 638 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.896e-7■■□□□ 11.5
UBE2B-201ENST00000265339 HOXC13P31276 330 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TTC7BQ86TV6 843 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 IGFLR1Q9H665 355 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 DTLQ9NZJ0 730 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 BANF1O75531 89 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 FGF19O95750 216 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ADRA1DP25100 572 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 AP2B1P63010 937 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ACAD11Q709F0 780 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CPQQ9Y646 472 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MCF2LO15068 1137 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TEAD2Q15562 447 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RASSF3Q86WH2 238 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TDRPQ86YL5 185 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 DENND1CQ8IV53 801 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NPWQ8N729 165 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NETO2Q8NC67 525 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ARMCX1Q9P291 453 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TYROBPO43914 113 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PIAS1O75925 651 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CKMP06732 381 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HTR7P34969 479 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TMED1Q13445 227 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RAPH1Q70E73 1250 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 LEMD2Q8NC56 503 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SENP1Q9P0U3 644 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 B2RBV5 119 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 F8W8V4 182 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ACSL4O60488 711 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CIB2O75838 187 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GLP2RO95838 553 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RBP3P10745 1247 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RAP1GDS1P52306 607 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A9P82251 487 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HYAL1Q12794 435 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GPR158Q5T848 1215 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CHSY1Q86X52 802 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SKA1Q96BD8 255 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MPP6Q9NZW5 540 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PAPLNO95428 1278 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 IFNB1P01574 187 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ITGAVP06756 1048 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 KRT4P19013 534 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NR2C2P49116 596 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CDK16Q00536 496 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MED21Q13503 144 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL22Q6P050 247 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms