RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261439.8

TBC1D1-201, Transcript of TBC1 domain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TBC1D1, Length 5,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM84AQ96KN4 292 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 MAGP20916 626 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 DGKAP23743 735 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 NOMO3P69849 1222 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 IRF8Q02556 426 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ACOX1Q15067 660 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ACSS2Q9NR19 701 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CLN6Q9NWW5 311 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ZNF222Q9UK12 451 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.69□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ALDH2P05091 517 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 GTF2BQ00403 316 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 MYDGFQ969H8 173 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PORCNQ9H237 461 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 STX11O75558 287 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CYP3A4P08684 503 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 SLC26A3P40879 764 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 TNFSF9P41273 254 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 QPRTQ15274 297 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 MZT2AQ6P582 158 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 DOK6Q6PKX4 331 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 DET1Q7L5Y6 550 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 SPOCK2Q92563 424 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 S100A14Q9HCY8 104 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PSMD10O75832 226 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CKBP12277 381 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CCNB1P14635 433 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CLCN5P51795 746 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 BNIP2Q12982 314 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 TMEM139Q8IV31 216 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CMTM6Q9NX76 183 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 WNT7AO00755 349 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM155BO75949 473 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PACS1Q6VY07 963 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 RECQL4O94761 1208 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PBX1P40424 430 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 TGFB2P61812 414 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ZNF846Q147U1 533 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 SLC1A5Q15758 541 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 GK5Q6ZS86 529 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 STARD8Q92502 1023 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 EURLQ9NYK6 297 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PIRTP0C851 137 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 FITM2Q8N6M3 262 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 BTN3A3O00478 584 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 SSNA1O43805 119 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CBFA2T3O75081 653 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 BPGMP07738 259 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 ANXA5P08758 320 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 GTF2A2P52657 109 aa14.67□□□□□ -0.06
TBC1D1-201ENST00000261439 CDH13P55290 713 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms