RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054950.3

RCN1-201, Transcript of reticulocalbin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN1, Length 2,572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1-201ENST00000054950 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SLC1A2P43004 574 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CDH15P55291 814 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SULT2A1Q06520 285 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 MYBPC3Q14896 1274 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ASB9Q96DX5 294 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TNIP3Q96KP6 325 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CCT7Q99832 543 aa20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CAPNS1P04632 268 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 STMN1P16949 149 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CKMT2P17540 419 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 IKBKEQ14164 716 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 AGKQ53H12 422 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 REP15Q6BDI9 236 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 NOTUMQ6P988 496 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 MAGEB16A2A368 324 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 DFFAO00273 331 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SLC22A2O15244 555 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 LRIG2O94898 1065 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SCNN1BP51168 640 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 NR1H2P55055 460 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 LILRA4P59901 499 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 GALNT2Q10471 571 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CSHL1Q14406 222 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 USP41Q3LFD5 358 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 PELI3Q8N2H9 469 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 KIFC1Q9BW19 673 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SPON1Q9HCB6 807 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SCN4AP35499 1836 aa20.48■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ATP6AP2O75787 350 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CHRNA4P43681 627 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 GALK1P51570 392 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 GPR32O75388 356 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 PHF21BQ96EK2 531 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ZNF560Q96MR9 790 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 FICDQ9BVA6 458 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 NRCAMQ92823 1304 aa20.47■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TIPRLO75663 272 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 DAOAP59103 153 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 LRP8Q14114 963 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 GAB3Q8WWW8 586 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 A0A0J9YVX5 310 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ASB14A6NK59 587 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ZNF839A8K0R7 811 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 MAGEB3O15480 346 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 YWHAQP27348 245 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 HSPA13P48723 471 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 NDST2P52849 883 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 ZNF597Q96LX8 424 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 SMOQ99835 787 aa20.46■□□□□ 0.87
RCN1-201ENST00000054950 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms