RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abcd2Q61285 741 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hspa1aQ61696 641 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Armc12Q80X86 340 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf168Q80XJ2 565 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clic5Q8BXK9 251 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbtb6Q8K088 423 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snx9Q91VH2 595 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Golm1Q91XA2 393 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc13a3Q91Y63 600 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dcaf6Q9DC22 876 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arid3bQ9Z1N7 568 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Skint1A7TZE6 364 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim12cD3Z3L3 497 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem265E9Q8G3 109 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OmdO35103 423 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pde6bP23440 856 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MylpfP97457 169 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbtb16Q3UQ17 673 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxo39Q5NBU5 443 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp17laQ61068 526 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf148Q61624 794 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gstt1Q64471 240 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem151aQ6GQT5 468 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp8Q80U87 1080 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajb13Q80Y75 316 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slco6c1Q8C0X7 706 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lurap1lQ8K2P1 221 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspan14Q8QZY6 270 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ClmpQ8R373 373 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krcc1Q99JT5 256 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SncaipQ99ME3 962 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Syap1Q9D5V6 365 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psmd12Q9D8W5 456 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspan3Q9QY33 253 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3173A6NAS3 172 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3020E9Q3J7 150 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm2897K7N6T7 172 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr743L7N1Y2 311 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Top3aO70157 1003 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01652 108 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rb1P13405 921 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fitm2P59266 262 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tekt4Q149S1 447 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P3h1Q3V1T4 739 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr792Q7TRH9 311 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Catsper3Q80W99 395 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xylt1Q811B1 953 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbtb41Q811F1 908 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lyve1Q8BHC0 318 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp398Q8BV16 643 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3411Q8C7R2 150 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rilpl2Q99LE1 197 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LiasQ99M04 373 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ProzQ9CQW3 399 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PigqQ9QYT7 581 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mllt10O54826 1068 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2b19O55071 492 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbp2P70695 339 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr174Q3U507 335 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc20a1Q61609 681 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kiaa1841Q68FF0 718 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RbfaQ6P3B9 350 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rad9bQ6WBX7 403 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TdrkhQ80VL1 560 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dyrk4Q8BI55 632 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ano4Q8C5H1 955 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snapc1Q8K0S9 389 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LipmQ8K2A6 422 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Irak3Q8K4B2 609 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gsg1Q8R1W2 324 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mob2Q8VI63 235 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc4Q99PH1 652 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lsm12Q9D0R8 195 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem114Q9D563 222 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CdylQ9WTK2 593 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bmp15Q9Z0L4 392 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CitP49025 2055 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm13941A2AJ38 245 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Foxm1O08696 760 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aqp4P55088 323 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TankP70347 448 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Txnl4aP83877 142 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700061G19RikQ08EE8 705 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dact3Q0PHV7 610 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cpne7Q0VE82 557 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ag2Q3UPL5 249 aa20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc8bQ5DU41 803 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22 ms