RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641949.1

MFSD8-256, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-256	ENST00000641949	RAMP2	O60895	175 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	APBB3	O95704	486 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	IL1R2	P27930	398 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SLC1A1	P43005	524 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MAPKAPK2	P49137	400 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PLK1	P53350	603 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	GNA12	Q03113	381 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	KRT81	Q14533	505 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	FUT11	Q495W5	492 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ANO7	Q6IWH7	933 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	C16orf46	Q6P387	395 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	DAAM2	Q86T65	1068 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	HMGB4	Q8WW32	186 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SUN2	Q9UH99	717 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949		H3BRJ5	948 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ARHGAP6	O43182	974 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SPOP	O43791	374 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MTA2	O94776	668 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TNNT1	P13805	278 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TCF4	P15884	667 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	GOT1	P17174	413 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	HOXA6	P31267	233 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MAN1A1	P33908	653 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	GJC1	P36383	396 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	IL12RB1	P42701	662 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	HCAR3	P49019	387 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	VAV2	P52735	878 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	CDH6	P55285	790 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SLC20A2	Q08357	652 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TCF15	Q12870	199 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TCEAL1	Q15170	157 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	DPYSL2	Q16555	572 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	CA9	Q16790	459 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RFX8	Q6ZV50	586 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM139	Q8IV31	216 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PRSS33	Q8NF86	280 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TEKT4	Q8WW24	435 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	LMLN	Q96KR4	655 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PEBP4	Q96S96	227 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	GABRG3	Q99928	467 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	CALN1	Q9BXU9	219 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MAGEH1	Q9H213	219 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TFR2	Q9UP52	801 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RAD54B	Q9Y620	910 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949		A0A1W2PQF6	199 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949		K7ESF4	209 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	BUB1	O43683	1085 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ALX3	O95076	343 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ACADM	P11310	421 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	HLA-E	P13747	358 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ERCC2	P18074	760 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	CNR2	P34972	360 aa		7.4	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms