RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 FZD8Q9H461 694 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 GLOD4Q9HC38 313 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 KRT84Q9NSB2 600 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 IL27RAQ6UWB1 636 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 TRPC4Q9UBN4 977 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 KCPQ6ZWJ8 1503 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 DCXO43602 365 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 SNX3O60493 162 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 SHBGP04278 402 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 IRF8Q02556 426 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 RNF43Q68DV7 783 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 MYLK2Q9H1R3 596 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF229Q9UJW7 825 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1W2PQ67 120 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 EOMESO95936 686 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 TRPC1P48995 793 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 NAGLUP54802 743 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 PFKFB4Q16877 469 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 TEX44Q53QW1 395 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 C16orf46Q6P387 395 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 OMDQ99983 421 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 IGFLR1Q9H665 355 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 SGTAO43765 313 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 CXCL14O95715 111 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 POLD2P49005 469 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 THOP1P52888 689 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 WNT3AP56704 352 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC34A1Q06495 639 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM187BQ17R55 369 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 GPR141Q7Z602 305 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ELMO1Q92556 727 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ATAD3AQ9NVI7 634 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 TBC1D14Q9P2M4 693 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ATP6V1G2O95670 118 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 LDLRP01130 860 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ABL2P42684 1182 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 GABRB2P47870 512 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 PLK1P53350 603 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 IYDQ6PHW0 289 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM220BPB1ANY3 271 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 RHOQP17081 205 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 TFEBP19484 476 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 WARSP23381 471 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ALDH9A1P49189 494 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 CRADDP78560 199 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 TRAF2Q12933 501 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 CRYMQ14894 314 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 PTPRNQ16849 979 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 TTC7BQ86TV6 843 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 SYT12Q8IV01 421 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 CDK20Q8IZL9 346 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ATG16L2Q8NAA4 619 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 PPP3R2Q96LZ3 170 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 TTYH3Q9C0H2 523 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 RAP2CQ9Y3L5 183 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 LRCH4O75427 683 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 PIGRP01833 764 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ELNP15502 786 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL3P39023 403 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 TAF10Q12962 218 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 EID3Q8N140 333 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 BBS2Q9BXC9 721 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 CEP44Q9C0F1 390 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 IKZF4Q9H2S9 585 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 C22orf31O95567 290 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 ADH1CP00326 375 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 SQLEQ14534 574 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRVP-205ENST00000641549 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms