RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CYP2D6	P10635	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PTPN2	P17706	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NPTX2	P47972	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NKX3-2	P78367	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CYB561D2	O14569	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GNGT2	O14610	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NDUFS2	O75306	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ENTPD5	O75356	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HSD17B2	P37059	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CDH6	P55285	790 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CUL2	Q13617	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ARC	Q7LC44	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KCNE1	P15382	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HSD3B2	P26439	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NOV	P48745	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	POLD2	P49005	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ALF	Q53S48	1182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	POTEG	Q6S5H5	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SNF8	Q96H20	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TRIM24	O15164	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	IFNA14	P01570	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GSTA1	P08263	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	G0S2	P27469	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RASA4B	C9J798	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MYO1D	O94832	1006 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AP2A1	O95782	977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AMPD1	P23109	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RGS6	P49758	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RGS19	P49795	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CCT8	P50990	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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