RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 TNFRSF21O75509 655 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 OR6B1O95007 311 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ACAP2Q15057 778 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ACOT1Q86TX2 421 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SUSD6Q92537 303 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 GANQ9H2C0 597 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 DLC1Q96QB1 1528 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM20BO75063 409 aa9.95□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.95□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 CCDC126Q96EE4 140 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ABCG4Q9H172 646 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 USP18Q9UMW8 372 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 PIPSLA2A3N6 862 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 FBXO21O94952 628 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SGPL1O95470 568 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 IGSF6O95976 241 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC26A3P40879 764 aa9.95□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 PDZK1Q5T2W1 519 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 HPS6Q86YV9 775 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SETD9Q8NE22 299 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SPOCK2Q92563 424 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC5A5Q92911 643 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 NEK6Q9HC98 313 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM221A6NGB7 291 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ATP6V1B2P21281 511 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 MUTP22033 750 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 BST1Q10588 318 aa9.95□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 LEMD2Q8NC56 503 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.95□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.95□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 NEO1Q92859 1461 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 TBX3O15119 743 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 KLRC4O43908 158 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 OR56A5P0C7T3 313 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 LBPP18428 481 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 MYLK3Q32MK0 819 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 CHST7Q9NS84 486 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.94□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PPM1 405 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 KATNA1O75449 491 aa9.94□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 AKR1D1P51857 326 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC18A1P54219 525 aa9.94□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.94□□□□□ -0.82
SPTAN1-228ENST00000635853 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.94□□□□□ -0.82
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SPTAN1-228ENST00000635853 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.94□□□□□ -0.82
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