RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623346.1

AC080038.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC080038.3, Length 1,952 nt, Biotype TEC.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC080038.3-201ENST00000623346 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 OLFM2O95897 454 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 ARNTP27540 789 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 GABRR2P28476 465 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 LIMK2P53671 638 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 C1QTNF8P60827 252 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 PDE1BQ01064 536 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 SEPT6Q14141 434 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 DCLK2Q8N568 766 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 MECRQ9BV79 373 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.08■■□□□ 1.13
AC080038.3-201ENST00000623346 A0A1B0GVM2 712 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 RHOCP08134 193 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ZNF235Q14590 738 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 PPM1JQ5JR12 505 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CHST9Q7L1S5 443 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TMC8Q8IU68 726 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 LRRC3Q9BY71 257 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TREX1Q9NSU2 369 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CPQQ9Y646 472 aa22.08■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 BGNP21810 368 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ERVFC1P60507 584 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CCDC63Q8NA47 563 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ZNF599Q96NL3 588 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 E2F8A0AVK6 867 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ILVBLA1L0T0 632 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 VAPBO95292 243 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 C8AP07357 584 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 HDCP19113 662 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 OXCT1P55809 520 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CNGA3Q16281 694 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 C16orf46Q6P387 395 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 SNX15Q9NRS6 342 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 STK39Q9UEW8 545 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.07■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 KDELR3O43731 214 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 LRG1P02750 347 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 GJA1P17302 382 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TTC16Q8NEE8 873 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ISL2Q96A47 359 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TCF25Q9BQ70 676 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 GGT7Q9UJ14 662 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 EMCNQ9ULC0 261 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ASB3Q9Y575 518 aa22.06■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 HIDE1A8MVS5 230 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 FSBPO95073 299 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TYK2P29597 1187 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 MAGEA12P43365 314 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 RGRP47804 291 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 Q6ZNB5 142 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 TBL1XO60907 577 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 ADH1AP07327 375 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 GABRB3P28472 473 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 IRX4P78413 519 aa22.05■■□□□ 1.12
AC080038.3-201ENST00000623346 FSCBQ5H9T9 825 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms