RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MYO9BQ13459 2157 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ILVBLA1L0T0 632 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DLGAP3O95886 979 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CDH1P12830 882 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GTF2A2P52657 109 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SP2Q02086 613 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GCNT1Q02742 428 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 OCA2Q04671 838 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PTP4A2Q12974 167 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ELP3Q9H9T3 547 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PSAT1Q9Y617 370 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 C9IYK1 514 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 H0Y858 1186 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FAM189A1O60320 539 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 C8BP07358 591 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CD19P15391 556 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PTPN2P17706 415 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINB1P30740 379 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GABRB2P47870 512 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 NOMO3P69849 1222 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 IRF5Q13568 498 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SPATC1Q76KD6 591 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ARCQ7LC44 396 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LHPPQ9H008 270 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PARVAQ9NVD7 372 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM233B4DJY2 109 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 K7ERI5 159 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DLGAP1O14490 977 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 IDH3BO43837 385 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SPNP16150 400 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SAT1P21673 171 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GARTP22102 1010 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TGM1P22735 817 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SFNP31947 248 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CUL2Q13617 745 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LY6KQ17RY6 165 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RNF146Q9NTX7 359 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SNPHO15079 494 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 KCNN4O15554 427 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TIMM44O43615 452 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LTFP02788 710 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2C8P10632 490 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 OSBPP22059 807 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PSME3P61289 254 aa8.29□□□□□ -1.08
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