RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SEPT4O43236 478 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 UNC5CO95185 931 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CATP04040 527 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 FCGR1AP12314 374 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SELPP16109 830 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP3A5P20815 502 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PIK3CGP48736 1102 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF614Q8N883 585 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 MECRQ9BV79 373 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 AHSPQ9NZD4 102 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 GMIPQ9P107 970 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PPM1AP35813 382 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPN9P43378 593 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 COMMD8Q9NX08 183 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS4BO75351 444 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 FSBPO95073 299 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 LBPP18428 481 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN8P19075 237 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 LMO2P25791 158 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ENPEPQ07075 957 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 STX19Q8N4C7 294 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF516Q92618 1163 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 APOA1P02647 267 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 POU1F1P28069 291 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT8P50990 548 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PFKPQ01813 784 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM192Q8IY95 271 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MTA2O94776 668 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ANXA5P08758 320 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 GABRR2P28476 465 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF43Q68DV7 783 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 FGF1P05230 155 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CLUHO75153 1309 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL5CA6NH57 179 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPN3P26045 913 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 STK32AQ8WU08 396 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 HDAC3O15379 428 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS14O43566 566 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PEX11AO75192 247 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA31D3P0C874 917 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CTPS1P17812 591 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD23AP54725 363 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 IRF8Q02556 426 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MARK4Q96L34 752 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 RPTORQ8N122 1335 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNA14P01570 189 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFV1P49821 464 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 EML3Q32P44 896 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC185Q8N715 623 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF398Q8TD17 642 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-208ENST00000615445 S100A5P33763 92 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms