RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GJB3O75712 270 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TFEBP19484 476 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAX7P23759 505 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADRA1AP35348 466 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1G1P47890 313 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB27AP51159 221 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALFQ53S48 1182 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNSTQ6PJW8 725 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIB1Q86YT6 1006 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NT5MQ9NPB1 228 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACOT9Q9Y305 439 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMBSP08397 361 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGAXP20702 1163 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSRP3P50461 194 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARPP19P56211 112 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WNT3AP56704 352 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLF10Q13118 480 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC12A1Q13621 1099 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RANBP10Q6VN20 620 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMC7Q7Z402 723 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BATF3Q9NR55 127 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYLKQ15746 1914 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPRDP23468 1912 aa11.94□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MATN2O00339 956 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX4I1P13073 169 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARSAP15289 507 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACADSP16219 412 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXC13P31276 330 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYP2C18P33260 490 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB10P61026 200 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EFEMP1Q12805 493 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMD5Q16401 504 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIPMQ5VYY2 423 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMCESQ96FZ2 354 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR78Q96P69 363 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDH22Q9UJ99 828 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AIM2O14862 343 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STMN1P16949 149 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCKP35557 465 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETFBP38117 255 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD86P42081 329 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NXNQ6DKJ4 435 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSMEM2Q8N112 164 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCML4Q8N228 414 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC26A7Q8TE54 656 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STYXQ8WUJ0 223 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DRC3Q9H069 523 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GMIPQ9P107 970 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TARM1B6A8C7 271 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRID2O43424 1007 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PEX11BO96011 259 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLK1P53350 603 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GEMP55040 296 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF33AQ06730 810 aa11.93□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSHL1Q14406 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms