RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF783Q6ZMS7 281 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP52Q8N1V2 620 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXJ1Q92949 421 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PRORYQ9H606 182 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SPTA1P02549 2419 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MYOFQ9NZM1 2061 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 J3QKU1 62 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 APOL1O14791 398 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TJP3O95049 919 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SGSHP51688 502 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 KDSRQ06136 332 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MMRN1Q13201 1228 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH18Q13634 790 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ALFQ53S48 1182 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MFN1Q8IWA4 741 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 FIBINQ8TAL6 211 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MPP6Q9NZW5 540 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP8B1Q9UNU6 501 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD54BQ9Y620 910 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 KNTC1P50748 2209 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D3BA6NDS4 549 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFS2O75306 463 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CNTN5O94779 1100 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TGM2P21980 687 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ETFBP38117 255 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC12A1Q13621 1099 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 BBS12Q6ZW61 710 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 RFX6Q8HWS3 928 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQF6 199 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ILVBLA1L0T0 632 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXB2P14652 356 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 AMPD1P23109 780 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 OR1E1P30953 314 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 IRAK1P51617 712 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NDST2P52849 883 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CARNMT1Q8N4J0 409 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PQLC3Q8N755 202 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF14Q9UBS8 474 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1B0GTW7 788 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MAOBP27338 520 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ITPKBP27987 946 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NTSR1P30989 418 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NR2C2P49116 596 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP15Q460N3 678 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NUDT18Q6ZVK8 323 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC13Q8NBP0 860 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF18AQ8NI77 898 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMB7Q99436 277 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEH1Q9H213 219 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 IL21RQ9HBE5 538 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TM7SF3Q9NS93 570 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPN8A6NHC0 703 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP104O60308 925 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 CST8O60676 142 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 RAMP2O60895 175 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 CER1O95813 267 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOCP08134 193 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT10P13645 584 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFV2P19404 249 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBB2AQ13885 445 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 DNASE2BQ8WZ79 361 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 GAREM1Q9H706 876 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 CD248Q9HCU0 757 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-214ENST00000592483 PLK2Q9NYY3 685 aa24.07■■□□□ 1.44
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