RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 AGBL4Q5VU57 503 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PIP4P1Q86T03 277 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RNF214Q8ND24 703 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KLK6Q92876 244 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ARRDC3Q96B67 414 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MYOCQ99972 504 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM7Q9C029 511 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ISCUQ9H1K1 167 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 EBF2Q9HAK2 575 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PREBQ9HCU5 417 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GDF3Q9NR23 364 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DMTF1Q9Y222 760 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRM-214ENST00000583153 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 H0Y8X5 98 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 TLR4O00206 839 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 WNT9AO14904 365 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 FLRT2O43155 660 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 DFNA5O60443 496 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 GJB3O75712 270 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 TMCC1O94876 653 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 WNT1P04628 370 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 GYPCP04921 128 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ITGAVP06756 1048 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF883P0CG24 379 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 HTR7P34969 479 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT1P36639 197 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 CTSKP43235 329 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R38P59533 333 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 HGSNATQ68CP4 663 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 PAF1Q8N7H5 531 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 HSPH1Q92598 858 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 HMCESQ96FZ2 354 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 FEM1CQ96JP0 617 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 HDAC8Q9BY41 377 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 THAP2Q9H0W7 228 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 DEF6Q9H4E7 631 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ZWILCHQ9H900 591 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 NEU3Q9UQ49 428 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 AKAP13Q12802 2813 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087X0T9 212 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 WASH4PA8MWX3 477 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 MYO1FO00160 1098 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 RNF103O00237 685 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 DFFAO00273 331 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 LATO43561 262 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 GSRP00390 522 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 UGT2B4P06133 528 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 FAM228BP0C875 321 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ADRB3P13945 408 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PRLRP16471 622 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ERCC2P18074 760 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 SPINK2P20155 84 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ITGB7P26010 798 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 AKT2P31751 481 aa8.45□□□□□ -1.06
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