RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	ZW10	O43264	779 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CD5L	O43866	347 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SLC19A2	O60779	497 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TACC1	O75410	805 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TOX	O94900	526 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF202	O95125	648 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	KIF20A	O95235	890 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PEPD	P12955	493 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF28	P17035	718 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ANXA13	P27216	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CD1C	P29017	333 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CSF2RB	P32927	897 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	RARRES1	P49788	294 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	RBPJ	Q06330	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGEF7	Q14155	803 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TREML4	Q6UXN2	200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CHST9	Q7L1S5	443 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ACOT1	Q86TX2	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	AMER3	Q8N944	861 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CT55	Q8WUE5	264 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SPOCK2	Q92563	424 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	C6orf50	Q9HD87	102 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM160	Q9NX00	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772		A6NL46	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TLR5	O60602	858 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	UNC5C	O95185	931 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MT-ND3	P03897	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CYBB	P04839	570 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ARAF	P10398	606 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	BMP6	P22004	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	UGT1A4	P22310	534 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CYP3A7	P24462	503 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PCSK1	P29120	753 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CDC27	P30260	824 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GPR3	P46089	330 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TAF6	P49848	677 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	BLK	P51451	505 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GUCY2F	P51841	1108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SOX8	P57073	446 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CDC16	Q13042	620 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	C3AR1	Q16581	482 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	LIPN	Q5VXI9	398 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MBLAC2	Q68D91	279 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GKN2	Q86XP6	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	LIX1	Q8N485	282 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ATL2	Q8NHH9	583 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	BSND	Q8WZ55	320 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	AZIN2	Q96A70	460 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TTC17	Q96AE7	1141 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	LHX9	Q9NQ69	397 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	IL37	Q9NZH6	218 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GGA2	Q9UJY4	613 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PADI1	Q9ULC6	663 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772		A0A0D9SFI3	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772		A6NNC1	897 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GABRD	O14764	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TGFB1I1	O43294	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	KLK8	O60259	260 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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