RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.41■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.41■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 KCNK5O95279 499 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 SLC14A1Q13336 389 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 DPYSQ14117 519 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 NEK5Q6P3R8 708 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 GAREM1Q9H706 876 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 EBF2Q9HAK2 575 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 SP110Q9HB58 689 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 DMTF1Q9Y222 760 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM131Q92545 1883 aa21.4■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 CACNA1AO00555 2505 aa21.39■■□□□ 1.02
SNAP23-216ENST00000568331 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 J3KR12 359 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 LATO43561 262 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PRAMEF11O60813 436 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PROSCO94903 275 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PCDH8O95206 1070 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 CD38P28907 300 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 CDH6P55285 790 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 TAS2R38P59533 333 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 KIF19Q2TAC6 998 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 HLA-BQ31612 363 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 UPK3BL1B0FP48 263 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 RNF103O00237 685 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 VILLO15195 856 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 UGT2B4P06133 528 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ADRB3P13945 408 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 AMPD1P23109 780 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 GKP32189 559 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 GJC1P36383 396 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 BNC1Q01954 994 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 AFMIDQ63HM1 303 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 LAYNQ6UX15 382 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 NETO2Q8NC67 525 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PDFQ9HBH1 243 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.38■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 DOCK9Q9BZ29 2069 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 A0A1W2PQU0 124 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 C10orf142B7Z368 130 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PALMO75781 387 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 CEACAM1P13688 526 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 SERPINB6P35237 376 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF75DP51815 510 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 IL10RBQ08334 325 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 MESDQ14696 234 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 CYTH1Q15438 398 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 HORMAD1Q86X24 394 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 NPWQ8N729 165 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 DEFB124Q8NES8 71 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 RAB7BQ96AH8 199 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 LHX3Q9UBR4 397 aa21.37■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 NEMP1O14524 444 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 GJB3O75712 270 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 KRT7P08729 469 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF883P0CG24 379 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 STAT4Q14765 748 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 GRM3Q14832 879 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 TC2NQ8N9U0 490 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 KCTD6Q8NC69 237 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 FEM1CQ96JP0 617 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 EXOC2Q96KP1 924 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 IL21RQ9HBE5 538 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SNAP23-216ENST00000568331 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms