RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 EXOC2Q96KP1 924 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 OMDQ99983 421 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM186AA6NE01 2351 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 KRIT1O00522 736 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 RHOBTB1O94844 696 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 IGSF6O95976 241 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 CCNCP24863 283 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 PSKH2Q96QS6 385 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 GPR174Q9BXC1 333 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 SEPT3Q9UH03 358 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 RAB23Q9ULC3 237 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-207ENST00000559494 MATN3O15232 486 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 NDUFS2O75306 463 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CSNK1DP48730 415 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CNTN1Q12860 1018 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 ELF2Q15723 593 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 BBS12Q6ZW61 710 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PGBD5Q8N414 524 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 TEX26Q8N6G2 289 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CCNYQ8ND76 341 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 MAML1Q92585 1016 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 FATE1Q969F0 183 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 HDAC11Q96DB2 347 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 OLFM3Q96PB7 478 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 LGMNQ99538 433 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 USP34Q70CQ2 3546 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PRR23AA6NEV1 266 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PTPN7P35236 360 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PTGER3P43115 390 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 NR2C2P49116 596 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PDK1Q15118 436 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 MARC1Q5VT66 337 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 SRLQ86TD4 932 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 SGK2Q9HBY8 427 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 FZD4Q9ULV1 537 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 GJB3O75712 270 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 UGT2B4P06133 528 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 TGM2P21980 687 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 RENBPP51606 427 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 RAD51Q06609 339 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 AGBL4Q5VU57 503 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM122AQ96E09 287 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 LOXL4Q96JB6 756 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PIEZO1Q92508 2521 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 ZSCAN12O43309 604 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 SEMA4FO95754 770 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CCNB1P14635 433 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CR2P20023 1033 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 CETN2P41208 172 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 MMP13P45452 471 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 SCNN1BP51168 640 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 MAXP61244 160 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF33AQ06730 810 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF235Q14590 738 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN3-207ENST00000559494 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms