RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 BRF2Q9HAW0 419 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 KCND2Q9NZV8 630 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 KDM5DQ9BY66 1539 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM247A6NEH6 219 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TGFB1I1O43294 461 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 UGDHO60701 494 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SERPINC1P01008 464 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 MPGP29372 298 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 POLD2P49005 469 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 FOXF2Q12947 444 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ME3Q16798 604 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 MOB3CQ70IA8 216 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TRIM74Q86UV6 250 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TRIM73Q86UV7 250 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 GALNT16Q8N428 558 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 FAR1Q8WVX9 515 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 HIPK3Q9H422 1215 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 KRT84Q9NSB2 600 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 IQGAP1P46940 1657 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SYNMO15061 1565 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PLXNC1O60486 1568 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQM1 296 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 IFNL4K9M1U5 179 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 RHODO00212 210 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 USP12O75317 370 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TACC1O75410 805 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TUBB4AP04350 444 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CLEC3BP05452 202 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 GALTP07902 379 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CD63P08962 238 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 COX7A2P14406 83 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CHMP24386 653 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ICAM3P32942 547 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ABCD1P33897 745 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 NHLH1Q02575 133 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 STIM1Q13586 685 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SYTL3Q4VX76 610 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 FAM57BQ71RH2 274 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 DDIASQ8IXT1 998 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 KLHL29Q96CT2 875 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 KLHL15Q96M94 604 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PIP5K1AQ99755 562 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 NEURL4Q96JN8 1562 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 PZPP20742 1482 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 TP73O15350 636 aa4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 EDN2P20800 178 aa4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CIITAP33076 1130 aa4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 ARHGAP25P42331 645 aa4.93□□□□□ -1.62
PRPF39-212ENST00000557477 CPA2P48052 419 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms