RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	GNS	P15586	552 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	TGM1	P22735	817 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ITGB7	P26010	798 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	METAP1	P53582	386 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	LMNB2	Q03252	620 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	GRM3	Q14832	879 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	CYTH1	Q15438	398 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	BBS5	Q8N3I7	341 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	SNX19	Q92543	992 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	HDAC8	Q9BY41	377 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	SEPT3	Q9UH03	358 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	MX2	P20592	715 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	RENBP	P51606	427 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC6	Q16204	474 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	AGBL4	Q5VU57	503 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	FRYL	O94915	3013 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	FSBP	O95073	299 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	NEK3	P51956	506 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	GALNT2	Q10471	571 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF235	Q14590	738 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	PQLC3	Q8N755	202 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	ARRDC3	Q96B67	414 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	CACNA1E	Q15878	2313 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PCNX1-206	ENST00000554292	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	PLK4	O00444	970 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	APOL1	O14791	398 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	MAFK	O60675	156 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	CSNK1D	P48730	415 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	CCR5	P51681	352 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	PREB	Q9HCU5	417 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	UGT2B4	P06133	528 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	MAPK8	P45983	427 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	RFX6	Q8HWS3	928 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	BIRC7	Q96CA5	298 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	EXOC2	Q96KP1	924 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	PSKH2	Q96QS6	385 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	28.8	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	CFI	P05156	583 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	CD27	P26842	260 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGAP8	P85298	464 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	28.8	■■■□□ 2.2
PCNX1-206	ENST00000554292	TFDP2	Q14188	446 aa		28.8	■■■□□ 2.2

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