RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 DCAF6Q58WW2 860 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TRNP1Q6NT89 227 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 IFI44Q8TCB0 444 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 MAPK15Q8TD08 544 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 NT5C3BQ969T7 300 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TRIM11Q96F44 468 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 ABCG4Q9H172 646 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SARDHQ9UL12 918 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 FLNCQ14315 2725 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CPED1A4D0V7 1026 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TNFSF15O95150 251 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 GJB6O95452 261 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 IL1BP01584 269 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 NTRK1P04629 796 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 MYBL1P10243 752 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 KRT3P12035 628 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 GOT1P17174 413 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CR2P20023 1033 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 FLT3P36888 993 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CLDN2P57739 230 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 NNTQ13423 1086 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 MAMLD1Q13495 774 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 GUSBP11Q6P575 273 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TMEM139Q8IV31 216 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SERPINB11Q96P15 392 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 NPY6RQ99463 290 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PARVAQ9NVD7 372 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 RRN3Q9NYV6 651 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 ANKRD62A6NC57 917 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 RNF103O00237 685 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SLC31A1O15431 190 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 IRAK2O43187 625 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 NOBOXO60393 691 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 IGLV3-27P01718 113 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 HGFP14210 728 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 STAT4Q14765 748 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CLCA4Q14CN2 919 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PERM1Q5SV97 790 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TAC4Q86UU9 113 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 VASH2Q86V25 355 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 APCDD1Q8J025 514 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 EMC1Q8N766 993 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PTPRN2Q92932 1015 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PLD4Q96BZ4 506 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 ZNF653Q96CK0 615 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 THAP2Q9H0W7 228 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 FBRSQ9HAH7 460 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 FZD4Q9ULV1 537 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 K7ESM1 405 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PIAS2O75928 621 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 LCA5LO95447 670 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 CYP1A2P05177 515 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 THEGLP0DJG4 465 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 PDX1P52945 283 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-231ENST00000552222 TBX4P57082 545 aa14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms