RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550664.2

AC068643.2-204, human

TSL 3

Gene AC068643.2, Length 347 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AC068643.2-204	ENST00000550664	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	RUNX2	Q13950	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	GPR68	Q15743	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	EYA3	Q99504	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AC068643.2-204	ENST00000550664	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	BECN2	A8MW95	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TSPAN4	O14817	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	MTA2	O94776	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	CLDN7	O95471	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	POLB	P06746	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TFPI	P10646	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	NAGA	P17050	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	LIFR	P42702	1097 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	HDAC4	P56524	1084 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TRAF2	Q12933	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	MAPK7	Q13164	816 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	PKP1	Q13835	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	CDT1	Q9H211	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	RGS14	O43566	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	PRSS2	P07478	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	SLC2A4	P14672	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	CTPS1	P17812	591 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	POU1F1	P28069	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	CENPA	P49450	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	NUDT6	P53370	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	CDH15	P55291	814 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	GPS2	Q13227	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664		A0A1B0GVT2	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	CHL1	O00533	1208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	IKBKB	O14920	756 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AC068643.2-204	ENST00000550664	ATP2C2	O75185	946 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms