RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 PCSK7Q16549 785 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 FUT11Q495W5 492 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 CASC4Q6P4E1 433 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 AHI1Q8N157 1196 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 APOL2Q9BQE5 337 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 ECT2Q9H8V3 914 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 SCUBE2Q9NQ36 999 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTAB-206ENST00000549940 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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GNPTAB-206ENST00000549940 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 PARM1Q6UWI2 310 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 CPA6Q8N4T0 437 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 MRGPRX2Q96LB1 330 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 SIGLEC10Q96LC7 697 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 FBXO10Q9UK96 956 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 H3BQ06 376 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 ECI2O75521 394 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 MT-CO1P00395 513 aa28.07■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 MMP2P08253 660 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 ABHD2P08910 425 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 TSHRP16473 764 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 MGAT1P26572 445 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 SKOR1P84550 965 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 KDELC1Q6UW63 502 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 SUSD6Q92537 303 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 ZBTB9Q96C00 473 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 EXOC2Q96KP1 924 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 CCDC77Q9BR77 488 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 C5orf42Q9H799 3197 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 INSIG1O15503 277 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 NPY2RP49146 381 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 CAPN12Q6ZSI9 719 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 KDELC2Q7Z4H8 507 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 OR2W6PQ8NHA6 318 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 FGF14Q92915 247 aa28.06■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 ECT2LQ008S8 904 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC14A2Q15849 920 aa28.05■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 IGDCC3Q8IVU1 814 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 TADA1Q96BN2 335 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 IFT43Q96FT9 208 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 CFAP36Q96G28 342 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 NOD2Q9HC29 1040 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 HPS4Q9NQG7 708 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 EPS15L1Q9UBC2 864 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 NFS1Q9Y697 457 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 GOLGA6L10A6NI86 522 aa28.04■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 RUNX3Q13761 415 aa28.04■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 CEP85LQ5SZL2 805 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 MBLAC2Q68D91 279 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 RANBP10Q6VN20 620 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 MPP5Q8N3R9 675 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa28.04■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 K7ERQ8 282 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 TULP3O75386 442 aa28.03■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 SSTR1P30872 391 aa28.03■■■□□ 2.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 RALGPS1Q5JS13 557 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 ADIPOR2Q86V24 386 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 RNF135Q8IUD6 432 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 IL22Q9GZX6 179 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 DEC1Q9P2X7 70 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTAB-206ENST00000549940 HS3ST2Q9Y278 367 aa28.03■■■□□ 2.08
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