RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530368.1

RRM1-208, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 5

Gene RRM1, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-208	ENST00000530368	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CBY3	A6NI87	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SNAP23	O00161	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CLEC3B	P05452	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	MAPK4	P31152	587 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	FMO4	P31512	558 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TNFSF8	P32971	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	MMP13	P45452	471 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	POLD2	P49005	469 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	BLK	P51451	505 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	GAD2	Q05329	585 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	MTX1	Q13505	466 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	DPP10	Q8N608	796 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PERP	Q96FX8	193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	COG5	Q9UP83	839 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ATG13	O75143	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	YWHAQ	P27348	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CADM3	Q8N126	398 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	HSPB6	O14558	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	HEXA	P06865	529 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SLC2A4	P14672	509 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PTGER1	P34995	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CLDN2	P57739	230 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TAF11	Q15544	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	LHPP	Q9H008	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RRM1-208	ENST00000530368	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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