RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ETS1P14921 441 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SEC13P55735 322 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 AP1S1P61966 158 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf27AQ580R0 203 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 C8orf74Q6P047 294 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TADA1Q96BN2 335 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM170BA6NMN3 283 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 NFKB1P19838 968 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKCHP24723 683 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 FDFT1P37268 417 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 MAXP61244 160 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SDE2Q6IQ49 451 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 PJA1Q8NG27 643 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 CLDN23Q96B33 292 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA3CQ99985 751 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS45Q9NRW7 570 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 INSIG1O15503 277 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 C7P10643 843 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ALADP13716 330 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SCNN1BP51168 640 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 GRM3Q14832 879 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 MYLK3Q32MK0 819 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 VOPP1Q96AW1 172 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 EXOC2Q96KP1 924 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ERP44Q9BS26 406 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXQ1Q9C009 403 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 NOD2Q9HC29 1040 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TECTAO75443 2155 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ALOX15BO15296 676 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAM23O75077 832 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 METTL18O95568 372 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP2P08253 660 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 HLA-EP13747 358 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 IVDP26440 423 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMB4P28070 264 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 DSC2Q02487 901 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ITKQ08881 620 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 GPS1Q13098 491 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA5AQ13591 1074 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SRLQ86TD4 932 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 FBRSQ9HAH7 460 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ANXA9O76027 345 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 EPHX1P07099 455 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SERPINF2P08697 491 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RAD51Q06609 339 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 EOGTQ5NDL2 527 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF366Q8N895 744 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB17Q9H0T7 212 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 CD248Q9HCU0 757 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 CKAP5Q14008 2032 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 SIN3BO75182 1162 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGEA6P43360 314 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms