RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522638.1

IGKV3D-34-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3D-34 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV3D-34, Length 302 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3D-34-201ENST00000522638 STX6O43752 255 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GCNT3O95395 438 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 VNN1O95497 513 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C8BP07358 591 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ALPIP09923 528 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CD1EP15812 388 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TNNI1P19237 187 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PDCP20941 246 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CSF2RBP32927 897 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HK3P52790 923 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PLK1P53350 603 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LIMK2P53671 638 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RAB15P59190 212 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PPARDQ03181 441 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CYP24A1Q07973 514 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 INCA1Q0VD86 236 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DPYDQ12882 1025 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TRPC3Q13507 836 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MAP7Q14244 749 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ERV3-1Q14264 604 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TCEA2Q15560 299 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DLG2Q15700 870 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ALG11Q2TAA5 492 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF667Q5HYK9 610 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MS4A13Q5J8X5 152 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MIIPQ5JXC2 388 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DCAF12Q5T6F0 453 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FAXCQ5TGI0 409 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CPZQ66K79 652 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KCTD16Q68DU8 428 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PIM3Q86V86 326 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PIGZQ86VD9 579 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SKAP1Q86WV1 359 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 AGBL5Q8NDL9 886 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CCDC112Q8NEF3 446 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TMIEQ8NEW7 156 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR2A12Q8NGT7 310 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ASB12Q8WXK4 309 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KCTD13Q8WZ19 329 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PNPLA2Q96AD5 504 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CENPTQ96BT3 561 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DNAJC19Q96DA6 116 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ALG14Q96F25 216 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OLFML3Q9NRN5 406 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRIT1Q9P2V4 623 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CROTQ9UKG9 612 aa6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ANK2Q01484 3957 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 M0QYT0 321 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRRTM2O43300 516 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 AP1G1O43747 822 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 STK17BO94768 372 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZBED1O96006 694 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADRB3P13945 408 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CD99P14209 185 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PDGFRAP16234 1089 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 BPIP17213 487 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NFKBIAP25963 317 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CD1CP29017 333 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHRNA3P32297 505 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HOXD13P35453 343 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CLCN1P35523 988 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NNMTP40261 264 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC11A2P49281 568 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 THOP1P52888 689 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ITGA1P56199 1179 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PER3P56645 1201 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR1D5P58170 312 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 YPEL5P62699 121 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SULT2A1Q06520 285 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ART3Q13508 389 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC12A1Q13621 1099 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZSCAN30Q86W11 494 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GKN2Q86XP6 184 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SYCP3Q8IZU3 236 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHST14Q8NCH0 376 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa5.99□□□□□ -1.45
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms