RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 GRM8O00222 908 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 HSPB6O14558 160 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 IGLV2-11P01706 119 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 F7P08709 466 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 BNC1Q01954 994 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CDK18Q07002 472 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ATG9BQ674R7 924 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 MTFR2Q6P444 385 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 VPS52Q8N1B4 723 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ADGRG7Q96K78 797 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.12□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.11□□□□□ -1.59
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SGCE-211ENST00000522045 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CLDN7O95471 211 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FCGR2AP12318 317 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 AK2P54819 239 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
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SGCE-211ENST00000522045 GXYLT1Q4G148 440 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SYTL3Q4VX76 610 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 DSTYKQ6XUX3 929 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 RNF144BQ7Z419 303 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SERPINA11Q86U17 422 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.11□□□□□ -1.59
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SGCE-211ENST00000522045 MST1RQ04912 1400 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 A2MP01023 1474 aa5.11□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 AQP12BA6NM10 295 aa5.1□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 NUP155O75694 1391 aa5.1□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CGAP01215 116 aa5.1□□□□□ -1.59
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SGCE-211ENST00000522045 PLA2R1Q13018 1463 aa5.1□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CCDC181Q5TID7 509 aa5.1□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.1□□□□□ -1.59
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SGCE-211ENST00000522045 SHROOM2Q13796 1616 aa5.09□□□□□ -1.59
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SGCE-211ENST00000522045 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 RETSATQ6NUM9 610 aa5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 FAM71BQ8TC56 605 aa5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 TXNDC15Q96J42 360 aa5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 PIGSQ96S52 555 aa5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SGCE-211ENST00000522045 DONSONQ9NYP3 566 aa5.09□□□□□ -1.59
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SGCE-211ENST00000522045 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ERCC6Q03468 1493 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 A0A0A0MQY5 61 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SP1P08047 785 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MYBPC2Q14324 1141 aa5.08□□□□□ -1.6
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SGCE-211ENST00000522045 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
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SGCE-211ENST00000522045 RINLQ6ZS11 566 aa5.08□□□□□ -1.6
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SGCE-211ENST00000522045 C2CD4CQ8TF44 421 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 STYXQ8WUJ0 223 aa5.08□□□□□ -1.6
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SGCE-211ENST00000522045 C8orf48Q96LL4 319 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 RTKNQ9BST9 563 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 IQGAP1P46940 1657 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MADDQ8WXG6 1647 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SYNMO15061 1565 aa5.08□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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