RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC12A4Q9UP95 1085 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VDAC3Q9Y277 283 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSAG2Q9Y5P2 127 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MST1RQ04912 1400 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TLDC2A0PJX2 215 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GXYLT2A0PJZ3 443 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A6NNZ2 444 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPIPB5A8MRT5 1133 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RHPN2P1A8MT19 583 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ISM1B1AKI9 464 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMIM1B2RUZ4 78 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPIPB4C9JG80 1138 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGEF9O43307 516 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGSF3O75054 1194 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ITGA5P08648 1049 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYZAPP0CAP1 466 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARSAP15289 507 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STAT1P42224 750 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LIFRP42702 1097 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MLLT10P55197 1068 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC8A3P57103 927 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPL15P61313 204 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RIGQ13278 110 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATP1A4Q13733 1029 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNFAIP1Q13829 316 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CBFBQ13951 182 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAXCQ5TGI0 409 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF852Q6ZMS4 543 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF44Q7L0R7 432 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARRDC2Q8TBH0 407 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CREB3L4Q8TEY5 395 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIB2Q92519 343 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRAMD1AQ96CP6 724 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAAR9Q96RI9 348 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAAF1Q9BRP4 392 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYT11Q9BT88 431 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBTB26Q9HCK0 441 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNK9Q9NPC2 374 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR6C3Q9NZP0 311 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OGFRQ9NZT2 677 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM181Q9P2C4 612 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHPF2Q9P2E5 772 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TPCN1Q9ULQ1 816 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CELA1Q9UNI1 258 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PKP3Q9Y446 797 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR2W5A6NFC9 320 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 J3KTA2 159 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHL1O00533 1208 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CER1O95813 267 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRSS56P0CW18 603 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCGR2AP12318 317 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAX1P15863 534 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ITGA2P17301 1181 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAPN2P17655 700 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP3A7P24462 503 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRKCHP24723 683 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DCTDP32321 178 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PIGAP37287 484 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HLCSP50747 726 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COX10Q12887 443 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAPSQ13938 189 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OASLQ15646 514 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EFNB3Q15768 340 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C5orf22Q49AR2 442 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTFR2Q6P444 385 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM219Q86XT9 240 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERC1Q8IUD2 1116 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TPH2Q8IWU9 490 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q8N7P7 452 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PARD3BQ8TEW8 1205 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC20A1Q8WUM9 679 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCAMRQ8WWV6 532 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAR2Q96K12 515 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF354BQ96LW1 612 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCDHAC1Q9H158 963 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MVB12BQ9H7P6 319 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms