RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516443.1

RNU6-687P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 687, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-687P, Length 89 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-687P-201ENST00000516443 HLA-DOBP13765 273 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 BCL3P20749 454 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 UGT1A4P22310 534 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 NFKBIAP25963 317 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PGDP52209 483 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 UCP3P55916 312 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SCAND1P57086 179 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PAX8Q06710 450 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SPOCK1Q08629 439 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SEMA3BQ13214 749 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 EBI3Q14213 229 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 EIPR1Q53HC9 387 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 C10orf76Q5T2E6 689 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CEACAM19Q7Z692 300 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 IGFN1Q86VF2 1251 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 BBS10Q8TAM1 723 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LMBR1Q8WVP7 490 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 BADQ92934 168 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SGF29Q96ES7 293 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LAT2Q9GZY6 243 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 KLK12Q9UKR0 248 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RIMKLBQ9ULI2 386 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TNFSF13BQ9Y275 285 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LRRC14BA6NHZ5 514 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ACOD1A6NK06 481 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TIMM23O14925 209 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MID1O15344 667 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CHRNA5P30532 468 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC8A1P32418 973 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MTNR1BP49286 362 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 WNT3P56703 355 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ECT2LQ008S8 904 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 NECTIN1Q15223 517 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 EFNB3Q15768 340 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 STXBP5Q5T5C0 1151 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 Q6P435 159 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CLEC9AQ6UXN8 241 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCDC25Q86WR0 208 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PPP1R3BQ86XI6 285 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LSMEM2Q8N112 164 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 Q8N9L7 120 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CLRN3Q8NCR9 226 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MXD3Q9BW11 206 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCDC113Q9H0I3 377 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCSER2Q9H7U1 834 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 NUDT4Q9NZJ9 180 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MUTYHQ9UIF7 546 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PSAT1Q9Y617 370 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 A6NL46 340 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CLIC2O15247 247 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ASNSP08243 561 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 FGRP09769 529 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MYZAPP0CAP1 466 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 YY1P25490 414 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CHATP28329 748 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 EFNA5P52803 228 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TERF1P54274 439 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 C3orf36Q3SXR2 165 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TTC7BQ86TV6 843 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ODF3L1Q8IXM7 274 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SPATA22Q8NHS9 363 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TOMM40LQ969M1 308 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GDF15Q99988 308 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TGIF2Q9GZN2 237 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 WDCPQ9H6R7 721 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 IL17CQ9P0M4 197 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PLCL2Q9UPR0 1127 aa-0.46□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms