RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCNS2Q9ULS6 477 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPIPB5A8MRT5 1133 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPIPB4C9JG80 1138 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MID1O15344 667 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IL33O95760 270 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NCLP19338 710 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TYMPP19971 482 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRKCHP24723 683 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCTP40126 519 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CARSP49589 748 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLCNKBP51801 687 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RELQ04864 619 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C3orf38Q5JPI3 329 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM240Q5SV17 173 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM171A1Q5VUB5 890 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRIM65Q6PJ69 517 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DOK6Q6PKX4 331 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UNC13DQ70J99 1090 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TICAM1Q8IUC6 712 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR2L2Q8NH16 312 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAR2Q96K12 515 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AGAP3Q96P47 875 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSF3RQ99062 836 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MSTO1Q9BUK6 570 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RTN4RQ9BZR6 473 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LHPPQ9H008 270 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBTB26Q9HCK0 441 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMOD4Q9NZQ9 345 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDH22Q9UJ99 828 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C2CD2Q9Y426 696 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USP19O94966 1318 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GXYLT2A0PJZ3 443 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ISM1B1AKI9 464 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 H3BML4 177 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 J3KR12 359 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BCL2L11O43521 198 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HLA-DOBP13765 273 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GYS1P13807 737 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BRAFP15056 766 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXC8P31273 242 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATICP31939 592 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DRD3P35462 400 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ITKQ08881 620 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MTMR1Q13613 665 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TUBB2AQ13885 445 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 P3H1Q32P28 736 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C5orf22Q49AR2 442 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDSS1Q5T2R2 415 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NCAPH2Q6IBW4 605 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF852Q6ZMS4 543 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STPG4Q8N801 248 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DDHD1Q8NEL9 900 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRHL3Q8TE85 626 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRIB2Q92519 343 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSPBAP1Q96EW2 488 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF354BQ96LW1 612 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TUBB2BQ9BVA1 445 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR83Q9NYM4 423 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZIM2Q9NZV7 527 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF212Q9UDV6 495 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASIC3Q9UHC3 531 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNKSO95271 1327 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHL1O00533 1208 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RFPL2O75678 378 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TFRCP02786 760 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCTDP32321 178 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DPP6P42658 865 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LIMK2P53671 638 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAS2R50P59544 299 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TLE3Q04726 772 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EFNB3Q15768 340 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SYTL3Q4VX76 610 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCAF6Q58WW2 860 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCTD8Q6ZWB6 473 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HDAC7Q8WUI4 952 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MTMR8Q96EF0 704 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT22Q9BRQ3 303 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSTL1Q9H114 145 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms