RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	USP29	Q9HBJ7	922 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FZD4	Q9ULV1	537 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	AK9	Q5TCS8	1911 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CEP250	Q9BV73	2442 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439		M0QZQ0	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CLIC1	O00299	241 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CER1	O95813	267 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MMP8	P22894	467 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	GALNS	P34059	522 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PLCD1	P51178	756 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PNLIPRP1	P54315	467 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SHC2	P98077	582 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	P3H1	Q32P28	736 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	C4orf46	Q504U0	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRABD2A	Q86V40	505 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPATA18	Q8TC71	538 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZBTB9	Q96C00	473 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TBX21	Q9UL17	535 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPTBN2	O15020	2390 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439		A0A1B0GUL7	405 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACTL6B	O94805	426 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MATN1	P21941	496 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUSP1	P28562	367 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	AKT1	P31749	480 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	AP2B1	P63010	937 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	ETFDH	Q16134	617 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCL14	Q16627	93 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM187B	Q17R55	369 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHSY1	Q86X52	802 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	CERS3	Q8IU89	383 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TOPBP1-208	ENST00000511439	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77

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