RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511392.5

CDV3-208, Transcript of CDV3 homolog, human

TSL 5 BASIC

Gene CDV3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDV3-208	ENST00000511392	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	PDCL	Q13371	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	STIL	Q15468	1287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	SCML4	Q8N228	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392		X6R8D5	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392		E5RJQ4	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392		M0R296	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	LEFTY2	O00292	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	KRIT1	O00522	736 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	GSTA4	O15217	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	CHAD	O15335	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	THAP12	O43422	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	GFPT2	O94808	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ZBED1	O96006	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	LTF	P02788	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ERBB2	P04626	1255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	GYPC	P04921	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ALAD	P13716	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ARSA	P15289	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	PSMC3	P17980	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	GDI1	P31150	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	SOX5	P35711	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	USP8	P40818	1118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	NOMO3	P69849	1222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	NFKB2	Q00653	900 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	CDR2	Q01850	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	MTF1	Q14872	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TAF12	Q16514	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDV3-208	ENST00000511392	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms