RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GAREM1Q9H706 876 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEC1O60732 1142 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAMEF11O60813 436 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PALMO75781 387 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 AMPD1P23109 780 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CD38P28907 300 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF75DP51815 510 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DPYSQ14117 519 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 STAT4Q14765 748 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GRM3Q14832 879 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB7BQ96AH8 199 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 FEM1CQ96JP0 617 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 KLC2Q9H0B6 622 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 INTUQ9ULD6 942 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 J3KR12 359 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NEMP1O14524 444 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 VILLO15195 856 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DFNA5O60443 496 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TCF4P15884 667 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MAN1A1P33908 653 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GJC1P36383 396 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP25P42331 645 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 IL10RBQ08334 325 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MESDQ14696 234 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SPA17Q15506 151 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 HLA-BQ31612 363 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ODF2Q5BJF6 829 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP58Q5T655 872 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC6A18Q96N87 628 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CALN1Q9BXU9 219 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PQU0 124 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 LATO43561 262 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNK5O95279 499 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 UGT2B4P06133 528 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CEACAM1P13688 526 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ADRB3P13945 408 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RENBPP51606 427 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2CBP62714 309 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2CAP67775 309 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PDK2Q15119 407 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CYTH1Q15438 398 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF19Q2TAC6 998 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 AFMIDQ63HM1 303 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC7BQ86TV6 843 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 BBS5Q8N3I7 341 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PAF1Q8N7H5 531 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TC2NQ8N9U0 490 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2I1PQ8NGU4 316 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 LAMA1P25391 3075 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 UPK3BL1B0FP48 263 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 GKP32189 559 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEA1P43355 309 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TAS2R38P59533 333 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 HORMAD1Q86X24 394 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms