RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC61Q9BV99 259 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 BICDL2A1A5D9 508 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 TULP2O00295 520 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 TNFSF15O95150 251 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 FGL2Q14314 439 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 CBWD6Q4V339 395 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 VPS51Q9UID3 782 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 M0QYV0 167 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL41O60662 606 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM49P0CI25 452 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM49CP0CI26 452 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 PDGFRAP16234 1089 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 RHOQP17081 205 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 CD58P19256 250 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 NUCB2P80303 420 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 SLC6A3Q01959 620 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ABHD18Q0P651 414 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 PDCLQ13371 301 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 PERM1Q5SV97 790 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 NLRP14Q86W24 1093 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF677Q86XU0 584 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 FATE1Q969F0 183 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ENO4A6NNW6 628 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 KCNK3O14649 394 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 KDELR3O43731 214 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 IVLP07476 585 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 RHOCP08134 193 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM23P36406 574 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 GPLD1P80108 840 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 EFHC2Q5JST6 749 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 AFMIDQ63HM1 303 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 GUSBP11Q6P575 273 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC31Q6UY01 552 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 CARFQ8N187 725 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 SHC3Q92529 594 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 EDEM1Q92611 657 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-210ENST00000503258 LRRK1Q38SD2 2015 aa7.84□□□□□ -1.16
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PDE4D-210ENST00000503258 WIPF3A6NGB9 483 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 SMC2O95347 1197 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 MPOP05164 745 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF18P17022 549 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 JUNDP17535 347 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 BMP6P22004 513 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 IGFALSP35858 605 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 SPRED1Q7Z699 444 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 PDILTQ8N807 584 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 IL12RB2Q99665 862 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 CLPBQ9H078 707 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 ABCG4Q9H172 646 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 NEU3Q9UQ49 428 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-210ENST00000503258 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.83□□□□□ -1.16
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