RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489614.5

NOD1-208, Transcript of nucleotide binding oligomerization domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene NOD1, Length 3,098 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1-208ENST00000489614 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.96□□□□□ -0.81
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NOD1-208ENST00000489614 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NOD1-208ENST00000489614 FCHO1O14526 889 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 NRP1O14786 923 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 FKBP6O75344 327 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 TCF4P15884 667 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 RAG1P15918 1043 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 NPR3P17342 541 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 ADCY8P40145 1251 aa9.96□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 GALTP07902 379 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 CCL23P55773 120 aa9.96□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 NR1H3Q13133 447 aa9.96□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.95□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 A8MX80 341 aa9.95□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 CHST7Q9NS84 486 aa9.95□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 ZNF487B1APH4 448 aa9.95□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 SMU1Q2TAY7 513 aa9.95□□□□□ -0.82
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NOD1-208ENST00000489614 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 CADM3Q8N126 398 aa9.95□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 SLCO2A1Q92959 643 aa9.95□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 MCEEQ96PE7 176 aa9.95□□□□□ -0.82
NOD1-208ENST00000489614 PEBP4Q96S96 227 aa9.95□□□□□ -0.82
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