RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PCGF5Q86SE9 256 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 BBOF1Q8ND07 529 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FAM3CQ92520 227 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CHFRQ96EP1 664 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RTKNQ9BST9 563 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CIPCQ9C0C6 399 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SUN2Q9UH99 717 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KCNK1O00180 336 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SNAP91O60641 907 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ANXA9O76027 345 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GSRP00390 522 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 IFNB1P01574 187 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 JCHAINP01591 159 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KRT14P02533 472 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TUBBP07437 444 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SRCP12931 536 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 VAV1P15498 845 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PTGIRP43119 386 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KCNJ1P48048 391 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CDK16Q00536 496 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KDSRQ06136 332 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RAD51Q06609 339 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TMEM215Q68D42 235 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 JAMLQ86YT9 394 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZNF567Q8N184 647 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TTC8Q8TAM2 541 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FCRL5Q96RD9 977 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MGME1Q9BQP7 344 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FBRSQ9HAH7 460 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 VPS45Q9NRW7 570 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 COL4A2P08572 1712 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PQ67 120 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PRRT4C9JH25 899 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 AP3B1O00203 1094 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ALOX15BO15296 676 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TMCC1O94876 653 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CD160O95971 181 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 IGSF6O95976 241 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CA4P22748 312 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GLDCP23378 1020 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RHOAP61586 193 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 AP1S1P61966 158 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CAV1Q03135 178 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ENPP2Q13822 863 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LRRC32Q14392 662 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CYTH1Q15438 398 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LPAL2Q16609 132 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SDE2Q6IQ49 451 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MRGPRX3Q96LB0 322 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ERP44Q9BS26 406 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GBA3Q9H227 469 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 EPC1Q9H2F5 836 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GLOD4Q9HC38 313 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 K7EQS6 105 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms