RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	MBTPS2	O43462	519 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	RGS10	O43665	173 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	COQ9	O75208	318 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	USP1	O94782	785 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	GLP2R	O95838	553 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ITGA2B	P08514	1039 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	NDUFV1	P49821	464 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PRKAG1	P54619	331 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	COASY	Q13057	564 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	GPS1	Q13098	491 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TEX19	Q8NA77	164 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	NCOA7	Q8NI08	942 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TBC1D5	Q92609	795 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	LENG9	Q96B70	501 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TBATA	Q96M53	351 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SETD4	Q9NVD3	440 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	VPS51	Q9UID3	782 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	NEDD4	P46934	1319 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	OR2W5	A6NFC9	320 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	AHRR	A9YTQ3	701 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	FAM20B	O75063	409 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ACTL6B	O94805	426 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	CFI	P05156	583 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	HGF	P14210	728 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	BMP5	P22003	454 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	NPTX2	P47972	431 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	CXADR	P78310	365 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SP2	Q02086	613 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	HYAL1	Q12794	435 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	DYRK1A	Q13627	763 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	GIT2	Q14161	759 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	GRM4	Q14833	912 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	WTAP	Q15007	396 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	GEN1	Q17RS7	908 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	RABL3	Q5HYI8	236 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SPART	Q8N0X7	666 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	GLG1	Q92896	1179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	NEK1	Q96PY6	1258 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TRIM5	Q9C035	493 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-215	ENST00000484179	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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