RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	KIF19	Q2TAC6	998 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	AADACL2	Q6P093	401 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TEX45	Q8NA69	505 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	GOLGA1	Q92805	767 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM18	Q96B42	140 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	IGSF21	Q96ID5	467 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	PKP4	Q99569	1192 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	DONSON	Q9NYP3	566 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	PLIN1	O60240	522 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	SERPINI2	O75830	405 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	SERPINB2	P05120	415 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	CSF1	P09603	554 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	CKMT1A	P12532	417 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	CD72	P21854	359 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TAF6	P49848	677 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TUBA1B	P68363	451 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGAP8	P85298	464 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	CYP4A11	Q02928	519 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	IL13RA2	Q14627	380 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	LINS1	Q8NG48	757 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM163	Q8TC26	289 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	TXNDC15	Q96J42	360 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CCNL1-223	ENST00000481173	OR6C68	A6NDL8	312 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM157A	C9JC47	383 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173		F5H423	210 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC25A17	O43808	307 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	IL1A	P01583	271 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	MMP3	P08254	477 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	MTNR1A	P48039	350 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	MXI1	P50539	228 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	MVD	P53602	400 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	FBXO43	Q4G163	708 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC38	Q502W7	563 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	RINL	Q6ZS11	566 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	RBFA	Q8N0V3	343 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	POF1B	Q8WVV4	589 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	RUBCN	Q92622	972 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CHODL	Q9H9P2	273 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A1B0GVM2	712 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	BMPR1B	O00238	502 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CHL1	O00533	1208 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	SEPT4	O43236	478 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	YWHAQ	P27348	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	PNPLA4	P41247	253 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	HTR3A	P46098	478 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CUL4B	Q13620	913 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CAPS	Q13938	189 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	TRIM14	Q14142	442 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CCNL1-223	ENST00000481173	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87

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