RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 SPAG6O75602 509 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 EPOP01588 193 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CCNB1P14635 433 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TPSB2P20231 275 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 IVDP26440 423 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RBL1P28749 1068 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 HOXA6P31267 233 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 RAB6CQ53S08 254 aa7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 MARC1Q5VT66 337 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 CEP68Q76N32 757 aa7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 MAML1Q92585 1016 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SMARCD2Q92925 531 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TEKT5Q96M29 485 aa7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 DFFAO00273 331 aa7.14□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 ST8SIA5O15466 376 aa7.14□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 KLKB1P03952 638 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 RHOCP08134 193 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 CA4P22748 312 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 PMLP29590 882 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 PHBP35232 272 aa7.14□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 ITGA8P53708 1063 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 GEMP55040 296 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 GAD2Q05329 585 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 SEMA5AQ13591 1074 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 GRM3Q14832 879 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.14□□□□□ -1.27
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