RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 CPXCR1Q8N123 301 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 GPT2Q8TD30 523 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 CD180Q99467 661 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 EYA3Q99504 573 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 GGA3Q9NZ52 723 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 NGFRP08138 427 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 GNLYP22749 145 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 CCKARP32238 428 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 MAPK9P45984 424 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 GPR12P47775 334 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 CAPSQ13938 189 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 FSCBQ5H9T9 825 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 MOB3CQ70IA8 216 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 LACTBL1A8MY62 500 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 PLA2G2AP14555 144 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 CTPS1P17812 591 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 Q0VFX4 171 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 RBFAQ8N0V3 343 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 CPXM2Q8N436 756 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 TEX45Q8NA69 505 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 NEUROG1Q92886 237 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 TMEM160Q9NX00 188 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGCE-210ENST00000472326 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 VWA5AO00534 786 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ITGB6P18564 788 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 DCTDP32321 178 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PGM1P36871 562 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 MYBPC2Q14324 1141 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 NFIL3Q16649 462 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 MON1BQ7L1V2 547 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 MON1AQ86VX9 555 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 SMC5Q8IY18 1101 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ELP4Q96EB1 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 YME1L1Q96TA2 773 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PROB1E7EW31 1015 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 HOXC6P09630 235 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 KCNJ4P48050 445 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ERV3-1Q14264 604 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 RETSATQ6NUM9 610 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 SLC22A25Q6T423 547 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 C17orf99Q6UX52 265 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ITM2AO43736 263 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PYGLP06737 847 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 T-ENOLP0DO92 83 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 NAGAP17050 411 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TNFRSF8P28908 595 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TTKP33981 857 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 NUDT6P53370 316 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ZNF585BQ52M93 769 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TMEM163Q8TC26 289 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 RNF183Q96D59 192 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CHL1O00533 1208 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 NCAM2O15394 837 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CENPAP49450 140 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CLCN5P51795 746 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 FAM27E3Q08E93 113 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 LPIN1Q14693 890 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.11□□□□□ -1.27
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